华西医院起源于美国、加拿大、英国等国基督教会1892年在成都创建的仁济、存仁医院；华西临床医学院起源于1914年的华西协合大学医科，是由美、加、英等国教会按西方医学教育模式建立的医学院。1937年抗日战争全面爆发，中央大学、燕京大学、齐鲁大学、金陵大学、金陵女子文理学院内迁成都，与华西协合大学联合办学办医，是时，华西坝大师云集、名家汇萃、盛况空前。1938年，有医学院的华大、中大、齐大组建联合医院；1946年，华西协合大学医院在现址全部建成，简称华西医院。 1951年，新中国人民政府接管华西协合大学；1953年，经院系调整为四川医学院，医院更名为四川医学院附属医院；1985年，四川医学院更名为华西医科大学，医院更名为华西医科大学附属第一医院；2000年，四川大学与华西医科大学合并，2001年5月，学院/医院更名为四川大学华西临床医学院/华西医院。