台州市椒江区疾控中心前身为椒江区卫生防疫站，于1980年创建，2001年9月经卫生体制改革分为台州市椒江区疾病预防控制中心、台州市椒江区卫生监督所，是卫生局下属的全民全额事业单位，2012年1月，区疾控中心与区监督所正式分立。单位于2010年2月搬进新大楼，现坐落在椒江区经东路518号，目前本中心现有建房面积约4295平方米（两个单位共有建筑面积约为7265平方米），内设综合办、质管办、疾病防治科、慢病科、环医科、理化检验科、微生物检验科、预防医学门诊部、健教所，共9个科室。