慈溪市疾病预防控制中心是在原慈溪市卫生防疫站基础上于2002年5月组建而成。组建后的疾控中心是实施疾病预防与控制、突发公共卫生事件应急处置、疫情及健康相关因素信息管理、健康危害因素监测与控制、实验室检测分析与评价、健康教育与健康促进、技术指导与应用研究等职能的公益性事业单位。是全市疾病预防与控制的技术指导中心和技术咨询、服务机构。　　 本中心现有职工68人，专业技术人员52人，其中高级职称15人，中级职称18人，初级20人。本中心设办公室、急性传染病防治所、慢性非传染性疾病防治所、地方病防治与媒介生物所、质量管理科、卫生监测科、水质监测科、检验科、艾滋病与结核病防治所、健康教育所。系浙江省技术监督局批准的计量认证单位及中国合格评定国家认可委员会批准的实验室国家认可单位。