肠梗阻： 当憩室突向肠腔内时，可引起肠套叠及阻塞性肠梗阻；若以脐带为轴心旋转，可发生小肠扭转；由于憩室纤维带与腹壁或腹腔内脏器相连，可压迫小肠形成肠梗阻；憩室还可嵌顿于疝囊内。以上各种因素均可引起肠梗阻。

肠套叠： 肠套叠是 Meckel 憩室致肠梗阻较常见类型。因憩室多位于回肠末端，憩室呈圆锥形，基底较宽者，当肠功能紊乱蠕动增强时，便可使憩室顶端翻转套入回肠腔内，成为肠套叠的起点。憩室翻入肠腔致肠管通过障碍，肠蠕动功能增强，把近段憩室翻入的肠管叠入远端肠腔内，形成回型肠套叠。套入肠管进一步推进发展，通过回盲瓣继续进入结肠时，则形成回结型肠套叠。有时憩室并不翻入回肠，而与肠管一同向远端回肠套入形成肠套叠。

憩室出血： 异位胃粘膜能分泌胃酸和胃蛋白酶，产生憩室消化性溃疡与出血，均是儿童病例常见的并发症。90% 的 Meckel 憩室合并出血的患者，憩室内均有异位胃粘膜存在。

憩室炎： 一般 Meckel 憩室基底部开口于回肠皆较宽，使其分泌物较易流入回肠排出，而不致积留于憩室内。当憩室解剖形态为指状或葫芦状，开口部狭小时导致引流不畅或有异物滞留时发生炎性病变。

憩室穿孔： 憩室的炎症和溃疡均可导致憩室穿孔。

肠梗阻： 其临床表现与一般的肠套叠、绞窄性肠梗阻或粘连性肠梗阻相同。Meckel 憩室引起的肠梗阻往往起病比较急骤，症状严重，常为绞窄性，可发生肠坏死而引起腹膜炎，出现恶心、呕吐、腹痛、腹胀、便秘或有红色果酱样粪便等症状。

肠套叠： Meckel 憩室并发肠套叠多发生于幼儿期以后，仍以阵发性腹痛（阵发性哭闹）、呕吐、果酱样血便为典型临床表现。查体：腹部仔细触诊多可触及套叠部位的腊肠样包块。直肠指诊除判定直肠内情多难鉴别。

憩室出血： 发病时突然出现大量无痛性便血，一次可达数百毫升，大便呈鲜红色或暗红色，患者可出现面色苍白、口渴、烦躁不安等休克症状，严重贫血。腹部检查无阳性体征。出血常会自行停止，或反复间歇出血。

憩室炎： 憩室炎临床多见于较大儿童，呈急性、亚急性发作，临床表现为突然的肚子疼，出现脐周或右下腹疼痛、压痛、腹肌紧张，还可伴有恶心呕吐、发热、血白细胞计数增高等。
症状和体征与急性阑尾炎相似，临诊时往往难以鉴别，故临床上常误诊急性阑尾炎接受手术，当术中发现阑尾正常且临床体征较重时，应探查回肠末端及回盲部，以免遗漏本病，进而发展成憩室坏死、穿孔的严重后果。
但憩室炎所致的炎性体征偏于腹中部，腹泻的机会较多，大便中可能带有脓血。Meckel 憩室炎最常见的症状是直肠无痛出血。粪便中可见鲜血或呈黑色柏油状。

憩室穿孔： 穿孔大多骤然发生症状，表现为剧烈腹痛、呕吐和发热。腹部检查有明显的腹膜刺激征，少数病例膈下有游离气体。

其他特殊并发症均少见。