遗传性侏儒症：是基因型疾病，多为常染色体隐性疾病，比如家族性生长激素缺乏、唐氏综合征等。
宫内侏儒症：在胚胎发育时就表现为生长缓慢，通常出生体重及身长就明显小于正常新生儿，且伴有其它躯体发育畸形及智力受损，对生长激素替代治疗不敏感。
内分泌激素性侏儒症：由于先天性缺乏某种激素或体内受体对该激素不敏感所致，比如呆小症、垂体性侏儒等。
代谢异常性侏儒症：由于缺失糖脂代谢过程中的关键酶所致，比如粘多糖病、肝糖原累积症。
体质性侏儒症。
长期营养缺乏、慢性疾病消耗：由于长时间的营养不良造成生长的延迟。
垂体及下丘脑肿瘤：该类肿瘤通过破坏及压迫作用，影响垂体及下丘脑激素分泌，特别是生长激素轴的分泌。
骨、软骨生长发育不良：各种原因导致的软骨、长骨骨骺端发育不良，主要包括甲状腺激素相关、先天性酶代谢相关、肾脏相关及基因相关。