儿童门静脉血栓：多见于先天性异常或者炎症感染。

成人门静脉血栓：多见于肝硬化，癌症，外伤或者手术等。

急性门静脉血栓通常是没有任何症状的，除非同时伴发其他症状或者并发症，比如胰腺炎，或肠系膜静脉栓塞。患者可能有突然发生的或在数日内进展的腹痛。患者还可能诉发热和消化不良等症状，肝硬化患者可能出现食管胃底静脉曲张破裂出血。

若同时存在峰型热，寒战和肝区疼痛，则多提示脓毒性门静脉血栓形成。

如果肠系膜上静脉阻塞，患者可能有腹部绞痛和腹泻，如果累及近端肠系膜静脉弓，则可能出现肠缺血并最终发生坏死。在此类患者中，腹痛可能放射至背部，持续超过 5～7 日，伴有腹水引起的腹胀和血性腹泻。

大多数情况下，门静脉血栓形成的临床特征表现为脾肿大，尤其好发于儿童，特别是在一段时间出现继发于门脉高压的静脉曲张出血。

窦后性门脉高压同时伴有肝硬化，或消化道大出血，可出现腹水的临床表现。

急性或者亚急性门静脉血栓形成时，表现为中度腹痛，或者突发性剧烈腹痛。

新生儿：主要是脐根部感染或脐炎导致腹腔感染所致；少数病因是先天性门静脉异常。

儿童：主要病因是门静脉炎，如急性阑尾炎，感染可以侵入门静脉系统导致炎症。

成人：腹部手术，比如脾切除手术；腹部外伤；恶性肿瘤压迫导致门静脉系统血流受阻；肝硬化；血液高凝状态，如骨髓增生性疾病均可导致门静脉血栓形成。