第一类是运动系统本身的问题造成的疾病，比如骨折、肌肉拉伤、关节扭伤等，这类疾病主要归属骨科治疗。
第二类支配运动系统的神经的问题造成的疾病，比如帕金森病、舞蹈症等，这类疾病归属神经内科治疗。
骨科相关的运动系统疾病，主要临床症状一般包括疼痛、麻木、肢体活动障碍、畸形、局部损伤部位的淤血瘀斑和肿胀等，累及的部位较为局限。
神经内科的运动系统疾病，主要临床症状一般包括肌肉无力感、肢体抖动、肌肉相对持续紧张，通常累及范围较大，为一片或大片的神经支配区域，一般不伴有明显的局部体征，比如局部疼痛、局部肿胀等。
外伤：是最为常见的骨科疾病原因。
肿瘤：包括骨骼本身的肿瘤和其他器官转移至骨骼的肿瘤。
感染：软组织或骨的感染，都可导致运动系统功能障碍。
先天发育异常：比如骨骼强度不足。
药物：如糖皮质激素可导致骨质疏松，抗骨质疏松药物可以造成股骨非典型性骨折等。